Avant 1200

fin du 7e / début du 8e siècle	La découverte d'ossements humains atteste de l'utilisation de l'espace autour de l'actuelle église municipale Saint-Michel comme lieu de sépulture.
entre 780 et 802	Isserstedt est le premier village appartenant aujourd'hui à la ville à être mentionné dans un registre de donations au monastère de Fulda.
entre 896 et 899	Le nom de la localité "Iani" est mentionné dans un registre de la dîme du monastère de Hersfeld. Le nom du lieu, dérivé d'une racine indo-européenne/germanique (à peu près : "région au passage de la rivière"), se réfère très probablement à l'actuelle Iéna, située sur un gué de la Saale et touchée par des voies de communication venant de la région d'Erfurt.
937	20 décembre : le château royal de "Chirihberg" ("Kirchberg") sur la Hausberg à l'est d'Iéna est mentionné. L'église qui porte ce nom est la première mention d'un lieu de culte dans la région d'Iéna.
974	20 juin : l'empereur Otto II séjourne à Kirchberg, ce qui laisse supposer la présence d'un palais royal ou impérial.
avant 1100	Un premier prédécesseur de l'église Saint-Michel est construit sous la forme d'une petite église romane en forme de salle.
vers 1100	La construction d'un deuxième château sur la Hausberg (Kirchberg II), propriété des margraves de Meissen de la Wettinie, commence. Le donjon, dont il reste un vestige, est considéré comme l'une des "sept merveilles" de Jena.
1145	15 août : la mention d'un Folmarus de Gene ("Volmar d'Iéna") comme témoin dans un document de l'archevêque de Mayence constitue une deuxième mention d'Iéna.
1149	30 novembre : la famille noble des burgraves de Kirchberg est citée pour la première fois en tant qu'administrateur des biens impériaux à Kirchberg.
vers 1150	La construction de l'église Saint-Jean, dont les parties les plus anciennes sont romanes, commence (dans ce qui deviendra le faubourg de Leutra).
1156	La famille noble des Greif(en)berger, éteinte en 1257, est citée pour la première fois. Un château sur le Hausberg, à son extrémité ouest, constitue le centre de leur domaine. Le village de Lobeda est mentionné pour la première fois (incertain).
1158	1er janvier : dans un document de Frédéric Barberousse, le Jenzig ("montem genzege") et le Gleissberg ("montem Glizberch") apparaissent.
1166	La mention des frères Hartmann et Otto de Lobdeburg (Lofdeburch) indique l'existence de Lobdeburg en tant que nouveau siège de la famille noble (les "Lobdeburger") venue de Franconie sur les bords de la Saale moyenne. (Il est également possible qu'elle ait été mentionnée plus tôt, vers 1150). La famille marque de manière décisive l'histoire de Jena au cours des quelque 150 années suivantes.
Entre 1175 et 1200	Cinq bractéates frappées à Iéna par les seigneurs de Lobdeburg sont parvenues jusqu'à nous, ce qui prouve que les Lobdeburg sont les seigneurs d'Iéna.
1182	16 septembre : Zwätzen (premier nom de lieu) est mentionné comme lieu situé entre Dornburg et Iéna. L'utilisation d'Iéna comme lieu de référence indique une position privilégiée par rapport aux autres agglomérations. Le document contient la première preuve certaine de la culture de la vigne à Iéna.
1185	Le margrave Otto de Meissen octroie au monastère d'Altzelle, entre autres, la dîme d'un vignoble sur le Jenzig.
vers 1200	Selon un plan de fondation, la zone d'habitation d'Iéna est (re)construite. Un système régulier de ruelles longitudinales et transversales - encore partiellement compréhensible aujourd'hui dans le centre-ville - voit le jour. Les seigneurs de Lobdeburg en sont les moteurs et les organisateurs. A partir du milieu du 13ème siècle, la ville naissante est divisée entre différentes lignées partielles de Lobdeburg, la dernière (1290) selon les quatre quartiers de la ville.