20 століття: 1940 - 1949

Іноземних примусових робітників дедалі частіше використовують на муніципальних та фондових підприємствах. На початок травня 1945 року їхня загальна кількість зростає до 14 000 осіб.

Липень/серпень: евакуйовані з Саарської області, яких після початку війни тимчасово розмістили в Єні, можуть повернутися додому.

18/19 серпня: Перші повітряні нальоти на Єну завдають лише незначної шкоди.

Жовтень: Публікація "Jenaer Judengeschichte" Герхарда Бухмана є частиною крайньої антиєврейської агітації в Німеччині в рамках підготовки до "остаточного вирішення" єврейського питання.

Після завершення навчання новобранців поліції, підготовлених у Єні, переводять до Краковаяк поліцейський батальйон 311 "Єна" під командуванням майора Вальтера Данца. Згодом цей підрозділ буде причетний до воєнних злочинів.

10 жовтня: У місті починається будівництво дев'яти висотних бункеріву рамках "Sonderaktion Luftschutzbau" (спеціальної кампанії з будівництва бомбосховищ) за наказомГітлера. Класифікація Єни як "бомбосховища першого порядку" (єдиного міста в Тюрингії) сприяє цим будівельним проектам.

Травень: на новозбудованому аеродромі Єна-Шенґлейна розпочинається навчальна програма з планеризму, насамперед для студентів. Аеродром також використовується для випробувальних польотів з метою дослідження озброєнь та як альтернативний аеродром для військово-повітряних сил.

11 листопада: Клара Розенталь, вдова професора Едуарда Розенталя, який зробив великий внесок у розвиток університету, міста і землі Тюрингія , покінчила життя самогубством через посилення антиєврейських утисків і заплановане виселення з дому. У 1928 році вілла Розенталь була заповідана місту Єна.

10 травня: Першим транспортом євреїв з Центральної Німеччини депортуютьдо Белжиця в окупованій Польщі, де їх або вбивають, або вивозять звідти до новостворених таборів знищення до кінця року. Це зачіпає дев'ятьох людей з Єни.

7 вересня: Власник фабрики Вільгельм Гардріх засновує некомерційний Фонд Вільгельма Гардріха, насамперед для підтримки роботи Товариства "Єнзіг" та інших єнських гірничодобувних компаній.

20 вересня: вісім мешканців Єни стали частиною ешелону з майже 900 євреїв, яких вивозили з Тюрінгії до табору Терезієнштадт.

Кінець червня: починаються роботи з підземного переміщення виробничих потужностей єнських збройових компаній, насамперед "Цейс" і "Шотт", пов'язаних з виробництвом озброєнь. Відповідні будівлі лише частково реалізовані до кінця війни. На будівельних роботах переважно використовують примусових робітників, для яких у місті створюють кілька барачних таборів, у тому числі табори примусової праці під керівництвом Організації Тодта на вулицях Мюленштрассе та Єнзігвег, починаючи з осені.

21 липня: Магнус Позер, провідний діяч антинацистського опору в Тюрингії разом з Теодором Нойбауером, помирає від отриманих травм після невдалої спроби втечі в лазареті концтабору Бухенвальд.

Літо: формуються плани підірвати Фухштурм, щоб не дати орієнтир для наближення ворожих бомбардувальників. Ефектна акція членів Товариства "Фухштурм" Віллі Лемзера та Отто Вагнера, які зачинилися у вежі, запобігає запланованому підриву.

4 жовтня: Перші 400 в'язнів з концтабору Бухенвальд переведені до табору-супутника на вулиці Лебстедтер Штрассе в Єні. До квітня 1945 року загалом майже 1 000 в'язнів виконують каторжні роботи на ремонтних роботах Рейхсбану, ремонтуючи вагони та локомотиви.

Жовтень/листопад: Чоловіче потомство від так званих змішаних шлюбів між єврейським і "німецьким по крові" подружжям та неєврейським подружжям від таких шлюбів ("євреєм по крові") з Єни (близько 40 осіб) відправляють на примусові роботи до таборів Організації Тодта.

5 грудня: ПомираєКарл Фоґль, почесний пастор церкви Vierzehnheiligen і релігійний соціаліст. Він до кінця життя підтримував зв'язок з антинацистським опором у Тюрингії.

31 січня: Останній транспорт євреїв з Єни відправляється до Терезієнштадта. За винятком лікарки "Лобеди" Клари Ґріфан, яка покінчила життя самогубством після отримання наказу про депортацію, всі учасники виживають і можуть повернутися до Єни. За сучасними даними, загалом близько 100 осіб, пов'язаних з Єною, стали жертвами нацистського "остаточного вирішення єврейського питання".

З лютого по квітень: у Єні відбулося кілька бомбардувань. 9 лютого будівля університетської бібліотеки була повністю зруйнована, в результаті чого загинув директор бібліотеки Теодор Локманн. Найважча атака здійснюється американськими бомбардувальниками 19 березня. Ці та кілька великих пожеж перетворюють на руїни 220 будинків, переважно в історичному центрі міста, а міська церква св. Михаїла зазнає значних пошкоджень. 9 квітня зруйновано товарну станцію, що паралізувало залізничний рух. Загалом під час бомбардувань гине майже 800 осіб, у тому числі близько 100 примусових робітників. Кількість мешканців Єни, які загинули під час Другої світової війни у складі Вермахту та інших військових формувань, оцінюється у понад 2 000 осіб.

11 квітня: Понад 4 000 в'язнів з концтабору Бухенвальд прогнали через Єну до Айзенберга під час так званого евакуаційного маршу ("маршу смерті"). 16 жертв, які поховані у спільній могилі на Східному кладовищі, задокументовані в районі Єни. Інші в'язні, яким вдалося втекти, були вбиті поблизу Гроссльобіхау членами фольксштурму.

12 квітня: Міст Камсдорф - один з мостів, підірваних німецьким вермахтом у районі Єни.

13 квітня - після невеликих, але запеклих боїв місто, евакуйоване частинами Вермахту, СС та поліції, капітулює і його займають американські війська.

17 квітня: д-р Рудольф Льоніс призначений мером міста від Комуністичної партії.

11 травня: Отто Вагнера призначено тимчасовим бургомістром (на посаді до 11 липня).

23-25 червня: 118 членів керівництва, провідних науковців, конструкторів та інженерів фондів "Цейс" і "Шотт" та їхні сім'ї, а також технічна документація і патенти вивозяться до американської зони окупації. Ця акція ("ми забираємо мізки") стала відправною точкою для подальшого створення заводів "Цейс" і "Шотт" в американській зоні окупації.

2 липня: Відповідно до домовленостей між союзниками, Тюрінгія переходить до радянської зони окупації. Радянські війська займають Єну після відходу американців і перебирають на себе функції окупаційної влади.

(з) серпня: Місто стикається зі зростаючою кількістю біженців і переміщених осіб, переважно з колишніх німецьких територій у Польщі та Чехії, тисячі з яких перебувають тут лише тимчасово як мандрівники. Близько 11 000 осіб залишаються в Єні на постійній основі, і їх необхідно забезпечити житлом і роботою.

5 серпня: виходить перша газета - "Тюрінгер Фольксцайтунг", афілійована з ХДНП.

13 вересня: муніципальний театр відновлює вистави.

1 жовтня: у єнських школах продовжується навчання.

Відновлює свою діяльність міська ощадна каса. У 1947 році за розпорядженням держави вона також перебирає на себе активи заснованої у 1833 році Благодійної каси і таким чином припиняє свою діяльність. Її будівля на Людвіг-Веймар-Гассе стає головним офісом Stadtsparkasse.

15 жовтня: Університет Фрідріха Шиллера - один з перших німецьких університетів, який знову відкрився з урочистою церемонією. 6 жовтня ректором був обранийкласичний філолог Фрідріх Цукер, який до цього обіймав посаду виконавчого директора. Викладання більшості предметів відновилося 3 грудня. Єнський університет був одним з небагатьох німецьких університетів, які не були закриті під час війни.

Макс Кеслер засновує в Єні видавництво "Вартбург". Видавництво, яке до 1986 року було приватним, а після 1990 року перетворилося на товариство з обмеженою відповідальністю зі штаб-квартирою у Веймарі, видає, серед іншого, протестантську щотижневу газету "Glaube und Heimat" для Тюрінгії.

19/20 січня: "Конференція єдності" СДПН і ХДС у Народному домі Єни за участю партійних лідерів Отто Ґротеволя і Вільгельма Піка готує об'єднання двох партій на державному рівні в Готі у квітні, яке відбудеться за гегемонії ХДС.

15 травня: в Університеті Фрідріха Шиллера відкривається підготовчий коледж. У 1949 році на його базі було створено Робітничо-селянський факультет (ABF).

24 червня: "Консультативні земельні збори Тюрінгії" під почесним головуванням єнської письменниці Рікарди Гух та під головуванням єнського адвоката-криміналіста Ріхарда Ланґестворюються як передпарламент першого повоєнного парламенту землі Тюрінгії.

13 липня: завершено реконструкцію підірваного Камсдорфського мосту.

1 серпня: містечко Лобеда та село Велніц приєднано до Єни.

29 серпня: Гарнізонну церкву перейменовано на Церкву миру.

8 вересня: Після останніх муніципальних виборів, проведених відповідно до демократичних принципів, Ліберально-демократична партія (ЛДП) проходить до нової муніципальної ради з 21 представником, ВДП - з 18, ХДС - з 10 і Християнсько-демократична партія (ХДС) - з одним. Генріх Мертенс (ЛДП) обраний бургомістром (до 11 вересня 1947 року).

22 жовтня: У рамках репарацій Радянському Союзу починається демонтаж заводу "Єна Цейс" та Єнського склозаводу (завершено у березні 1947 року). Запланованому повному демонтажу вдається запобігти через протести керівництва заводу та уряду землі Тюрінгія, але в Єні залишається лише невелика частина виробничих потужностей. Демонтаж супроводжується переведенням понад 300 спецпризначенців з обох заводів (деякі з сім'ями) до Радянського Союзу.

23 грудня: Едуард Гайнц (СЕПН) та д-р Фрідріх Шьомерус (ЛДП) стають почесними громадянами міста.

Починає свою роботу професійна пожежна команда. Попередня система добровільних пожежних команд залишається на місці.

Зима: Надзвичайно довга і холодна зима 1946/47 рр. значно ускладнює і затримує роботи з розчищення завалів у центрі міста.

18 червня: Засновано місцевий осередок Товариства вивчення радянської культури (з 1949 р. - Товариство німецько-радянської дружби = ТНД).

21 листопада: Йоганнес Гердеген (ЛДП) обраний міською радою новим мером Єни замість Генріха Мертенса, який втік до Західного Берліна .

24 грудня: нові дзвони церкви св. Михаїла дзвонять на Різдво.

з березня: посилення втручання радянської окупаційної влади та Міністерства національної освіти у Веймарі на чолі з Марією Торхорст в автономію університету призводить до "кризи Єнського університету". Це призвело до звільнення без попередження професора філософії Ганса Лейзеганга 27 жовтня . Лейзеганг, тимчасово ув'язнений за часів нацизму і позбавлений професорського звання, вважався критиком радянської університетської та академічної політики СЄПН. Після відставки двох буржуазних професорів з ректорату, 8 листопада ректором альма-матер вперше був обранийОтто Шварц, член SED. Наприкінці року демократично обрана студентська рада остаточно розпускається.

1 квітня: Затверджена урядом землі Тюрінгія, розпочинає свою діяльність "Муніципальна музична школа університетського міста Єни" (з 1951 року "Народна музична школа", з 1990 року "Єнська музично-художня школа").

24-28 червня: У рамках грошової реформи в радянській окупаційній зоні рейхсмарки - так звані купонні гроші, оскільки запаси рейхсмарок раніше були забезпечені клейкою маркою - замінюються на банкноти Deutsche Mark від Deutsche Notenbank.

Липень: Запрацювала водопровідна станція в Бургау. Вода подається з глибоких свердловин у долині Заале та долині Роди.

1 липня: Попри опір представників фонду та компаній, завершується процес націоналізації компаній-засновників "Карл Цейс" та "Шотт". Вони реорганізуються в "Народні підприємства" (Volkseigene Betriebe, VEB), спочатку як частина VVB Optik. Гуго Шрадестає генеральним директором VEB Carl Zeiss Jena (до 1966 року).

24 листопада: на ринковій площі відкривається перший магазин Державної торговельної організації (HO), де споживчі товари та продукти харчування можна було придбати за значно завищеними цінами без талонів або продовольчих карток.

30 березня: на основі злиття менших допоміжних лікарень на півночі Єни створено міську лікарню на Дорнбургерштрассе, 159.

Травень: "Робітничо-селянський факультет" (ABF) виникає на базі підготовчого відділення, яке існувало в університеті з 1946 року. Заклад, який проіснував до 12 липня 1963 року, готує дітей з раніше неосвічених верств населення до навчання в університеті. Водночас він слугує вихованню інтелігенції, яка відповідає системі і сприяє розпочатій зміні еліти. Школа ABF розмістилася в колишній будівлі Вищого регіонального суду на вулиці Август-Бебель-штрассе.

Після зруйнованого під час війни міського музею Єни на Вайґельштрассе відкривається перша виставка під назвою "Єна крізь віки" у Принцесиному сквері (Prinzessinnenschlösschen).

Вересень: Знесення центральної частини міста в основному завершено.

7 жовтня: з утворенням НДР і розпуском радянської військової організації в Тюрінгії командування Єни офіційно передає управління міською адміністрацією бургомістрові.