20 世纪：1940 - 1949 年

越来越多的外国强迫劳工被派往市政和基金会企业工作。到 1945 年 5 月初，他们的总人数增至约 14000 人。

7月/8月：战争开始后暂时安置在耶拿的萨尔州疏散人员可以回家了。

8月18/19日：对耶拿的首次空袭仅造成轻微损失。

10月： 格哈德-布赫曼（Gerhard Buchmann）撰写的《耶拿犹太史》一书出版 ，这是德国为准备 "最终解决 "犹太人问题而进行的极端反犹宣传的一部分。

在耶拿受训的警察新兵在完成训练后 被调往克拉科夫，编为耶拿 311 警察营，由指挥官 瓦尔特-丹茨少校（ Walter Danz）领导 。这支部队随后参与了战争罪行。

10月10日：作为 希特勒 下令开展的 "防空洞建设特别行动"（Sonderaktion Luftschutzbau）的一部分， 耶拿 开始修建九座高层掩体。耶拿被列为 "一级防空洞"（图林根州唯一的城市），这有利于这些建设项目。

5月：在新建的耶拿-舍恩格莱纳（Jena-Schöngleina）机场开始滑翔训练，主要针对学生。该机场还用于军备研究的试飞，并作为空军的备用机场。

11月11日： 为耶拿大学、城市和图林根州的发展做出巨大贡献的 爱德华-罗森塔尔（Eduard Rosenthal）教授的遗孀 克拉拉-罗森塔尔（Clara Rosenthal）面对日益增多的反犹太人骚扰和被逐出家门的计划自杀身亡。罗森塔尔别墅于 1928 年遗赠给耶拿市政府。

5月10日：在第一次运输中，来自德国中部的犹太人被运往 被占领波兰的贝维采，在那里他们要么被杀害，要么在年底前被送往新建立的灭绝营。来自耶拿的九人因此受到影响。

9月7日：厂主 威廉-海德里希（Wilhelm Härdrich ）成立了非营利性的威廉-海德里希基金会，主要用于支持耶拿矿业公司和延齐格协会的工作。

9月20日：8名耶拿人被从图林根州运往特莱西恩施塔特集中营的近900名犹太人中的一部分。

6 月底：耶拿军械公司（主要是蔡司和肖特）与军械有关的生产设施的地下搬迁工作开始。到战争结束时，相应的建筑才部分完工。建筑工程主要使用强迫劳工，并在市内建立了多个兵营来安置他们，其中包括托特（Todt）组织从秋季开始在米伦街（Mühlenstraße）和延齐格街（Jenzigweg）建立的强迫劳工营。

7月21日： 马格努斯-波泽尔（Magnus Poser）与 西奥多-诺伊鲍尔（Theodor Neubauer） 是图林根州反纳粹抵抗运动的主要人物，他在布痕瓦尔德集中营的医务室里因试图逃跑未果而受伤身亡。

夏季：炸毁富克斯图尔姆以避免为接近的敌军轰炸机提供地标的计划成形。 威利-莱姆塞（Willi Lemser ）和 奥托-瓦格纳（Otto Wagner）将自己锁在塔中，他们的壮举 阻止了拆除计划。

10 月 4 日：布痕瓦尔德集中营的首批 400 名囚犯被转移到耶拿 Löbstedter Straße 的卫星集中营。到 1945 年 4 月，共有近 1000 名囚犯在帝国铁路修理厂从事苦役，修理货车和机车。

10月/11月：来自耶拿的犹太人和 "德国血统 "配偶之间的所谓混血婚姻以及此类婚姻中的非犹太人配偶（"犹太血统"）所生的男性后代（约40人）被送往托特组织集中营从事强迫劳动。

12 月 5 日： Vierzehnheiligen 的名誉牧师、宗教社会主义者卡尔-沃格尔（Carl Vogl）去世。他一直与图林根的反纳粹抵抗运动保持联系，直到最后。

1月31日：最后一批犹太人从耶拿出发前往特莱西恩施塔特。除了洛贝达（Lobeda）的医生 克拉拉-格勒加恩（Klara Griefahn）在接到驱逐令后自杀身亡外 ，所有相关人员都幸存下来，并得以返回耶拿。据目前所知，共有约 100 名与耶拿有关的人成为纳粹 "犹太人问题最终解决方案 "的受害者。

2月至4月：耶拿遭到数次炸弹袭击。2 月 9 日，耶拿大学图书馆大楼被彻底摧毁，图书馆馆长 西奥多-洛克曼（Theodor Lockemann ）遇难 。3 月 19 日，美国轰炸机发动了最猛烈的袭击。这些袭击和几场大火将 220 座房屋烧为废墟，主要集中在历史悠久的市中心，圣米歇尔教堂也遭到严重破坏。4 月 9 日，火车站被毁，铁路交通瘫痪。共有近 800 人在轰炸中丧生，其中包括约 100 名强迫劳工。在第二次世界大战中丧生的德国国防军和其他军事单位的耶拿居民人数估计超过 2000 人。

4 月 11 日：布痕瓦尔德集中营的 4000 多名囚犯在所谓的撤离行军（"死亡行军"）中穿过耶拿，前往艾森堡。耶拿地区记录了 16 名受害者，他们被埋葬在东公墓的一个共同墓穴中。其他侥幸逃脱的囚犯则在格罗斯洛比考（Großlöbichau）附近被人民冲锋队成员杀害。

4月12日：卡姆斯多夫桥是德国国防军在耶拿地区炸毁的桥梁之一。

4月13日：经过小规模但激烈的战斗，由德国国防军、党卫军和警察部队撤离的该镇投降并被美军占领。

4月17日：鲁道夫-洛尼斯博士（Dr Rudolf Löhnis）被任命为共产党市长。

5 月 11 日： 奥托-瓦格纳 （Otto Wagner ）被任命为临时市长（任期至 7 月 11 日）。

6 月 23-25 日：来自蔡司和肖特基金会的 118 名管理层成员、主要科学家、设计师和工程师及其家属，以及技术文件和专利被转移到美国占领区。这一行动（"我们带走了大脑"）成为随后在美军占领区建立蔡司和肖特工厂的起点。

7月2日：根据盟国之间的协议，图林根被移交给苏联占领区。苏军在美军撤离后占领耶拿，并接管了占领国的职能。

(自）8 月：耶拿市面临越来越多的难民和流离失所者，他们主要来自波兰和捷克共和国的前德国领土，其中数千人只是作为旅行者临时逗留。约有 11000 人长期滞留耶拿，必须为他们提供住房和工作。

8月5日：第一份发行的报纸是隶属于基民党的《图林根人民报》。

9 月 13 日：市剧院恢复演出。

10月1日：耶拿学校继续教学。

城市储蓄银行恢复营业。1947年，根据国家命令，该银行还接管了成立于1833年的公园基金会（Stiftungssparkasse）的资产，并因此停止了活动。其位于路德维希-魏玛大街（Ludwig-Weimar-Gasse）的大楼成为城市公园的总部。

10 月 15 日：弗里德里希-席勒大学（Friedrich Schiller University）是首批举行重开典礼的德国大学之一。10月6日，古典语言学家 弗里德里希-扎克（Friedrich Zucker ）当选为校长 ，他之前担任的是常务董事一职。12月3日，大部分学科恢复了教学。耶拿大学是为数不多的在战争期间未被关闭的德国大学之一。

马克斯-凯斯勒（Max Keßler ）在耶拿创建了瓦特堡出版社。这家出版社在 1986 年之前一直由私人经营，1990 年后转变为一家总部设在魏玛的有限公司，主要为图林根州出版新教周报《Glaube und Heimat》。

1 月 19/20 日：社民党和基民党在耶拿市民之家召开 "统一会议"，党魁 奥托-格罗特沃尔（Otto Grotewohl）和威廉-皮克（Wilhelm Pieck）出席会议， 为 4 月两党在基民党的主导下在哥达实现州一级的统一做准备。

5 月 15 日：弗里德里希-席勒大学成立预科学院。1949 年，工人和农民学院（ABF）从中诞生。

6月24日："图林根州咨询议会 "成立，由耶拿作家 里卡达-胡赫（Ricarda Huch）担任名誉主席 ，耶拿刑事律师 理查德-兰格 （RichardLange ）担任主席， 作为战后图林根州议会的前议会。

7月13日：被炸毁的卡姆斯多夫大桥重建完工。

8月1日：洛贝达（Lobeda）小镇和沃尔尼茨（Wöllnitz）村并入耶拿。

8月29日：驻军教堂更名为和平教堂。

9月8日： 在按照民主原则举行的最后一次市政选举之后，自民党（LDP）以21名代表、社会民主党（SED）以18名代表、基民盟（CDU）以10名代表、文化联盟（Kulturbund）以1名代表当选为新一届市政委员会成员。 海因里希-默滕斯 （Heinrich Mertens ，自民党）当选为市长（至 1947 年 9 月 11 日）。

10 月 22 日：作为对苏联赔偿的一部分，耶拿蔡司工厂和耶拿玻璃厂开始拆除（1947 年 3 月完成）。由于工厂管理层和图林根州政府的抗议，计划中的全部拆除未能实现，但只有一小部分生产设施仍留在耶拿。在拆除的同时，两家工厂的 300 多名特种兵（其中一些人及其家属）也被转移到了苏联。

12 月 23 日： 爱德华-海因茨 （SED）和 弗里德里希-舍默鲁斯博士 （自民党）被授予耶拿荣誉市民称号。

专业消防队开始工作。之前的志愿消防队系统仍然保留。

冬季：1946/47 年冬季极其漫长和寒冷，大大阻碍和拖延了市中心的废墟清理工作。

6 月 18 日：苏联文化研究会（1949 年起更名为德苏友好协会 = DSF）地方分会成立。

11月21日： 约翰内斯-赫德根 （ Johannes Herdegen ）（自民党）被市议会选举 为耶拿新市长 ，接替逃往西柏林的 海因里希-梅尔滕斯 （ Heinrich Mertens ） 。

12月24日：圣米歇尔教堂的新钟声敲响圣诞节。

3月起：苏联占领军 和玛丽-托霍斯特（Marie Torhorst）领导下的魏玛国民教育部 对大学自治权的 干涉日益加剧， 导致了 "耶拿大学危机"。10月27日，哲学教授 汉斯-莱塞冈（Hans Leisegang） 在没有通知的情况下被解雇 。 莱塞冈在纳粹时期曾被暂时监禁，并被剥夺了教授职位，他被认为是苏联和德国社会民主党大学和学术政策的批评者。在两位资产阶级教授辞去校长职务后，11 月 8 日， SED 成员奥托-施瓦茨（Otto Schwarz ）首次当选母校校长。 年底，经民主选举产生的学生代表最终被解散。

4月1日：经图林根州政府批准，"耶拿大学城市立音乐学校 "开始运作（1951年起为 "民间音乐学校"，1990年起为 "耶拿音乐艺术学校"）。

6月24-28日：作为苏联占领区货币改革的一部分，帝国马克--即所谓的票面货币（因为帝国马克的存量以前都有粘合印章）--被德国票据银行的德国马克纸币取代。

7月：布尔高自来水厂投入使用。从萨勒河流域和罗达河流域的深井中取水。

7月1日：在基金会和公司代表的抵制下，卡尔蔡司和肖特基金会公司的国有化进程完成。它们被重组为 "Volkseigene Betriebe"（VEB），最初是 VVB Optik 的一部分。 雨果-施拉德成为 VEB 卡尔蔡司耶拿公司的总经理 （至 1966 年）。

11月24日：国营贸易组织（HO）的第一家商店在集市广场开业，在这里可以以高昂的价格购买消费品和食品，无需配给券或配给卡。

3月30日：位于多恩堡大街159号的市立医院由耶拿北部较小的辅助医院合并而成。

5月："工人和农民学院"（ABF）从1946年起就存在于耶拿大学的预科系中脱颖而出。该机构一直存在到1963年7月12日，为以前未受过教育的人群中的儿童进入大学学习做准备。与此同时，它还负责培养符合体制的知识分子，促进精英阶层的变革。ABF 被指定将位于奥古斯特-贝贝尔大街（August-Bebel-Straße）的前地区高等法院大楼作为其校舍。

位于魏格尔大街（Weigelstraße）的耶拿市立博物馆在战争中被毁，此后，在普林津辛恩施洛辛（Prinzessinnenschlösschen）举办了题为 "耶拿的历史 "的首次展览。

9月：市中心的拆除工作基本完成。

10月7日：随着民主德国的成立和图林根州苏联军事组织的解散，耶拿司令部正式将城市管理权移交给市长。