XV secolo

tra il 1404 e il 1409	Dopo lunghe dispute tra il patriziato cittadino, da un lato, e le corporazioni degli artigiani e dei suburbani, dall'altro, a questi ultimi viene data maggiore voce in capitolo nel consiglio. In futuro, gli artigiani poterono occupare alcune cariche cittadine tra le loro fila. È documentata l'esistenza di 14 corporazioni.
1406	Sulla Saale, tra Rasenmühle e Kunitz, sono documentate quattro acque di pesca affittate a istituzioni e privati. L'abbondanza di pesce nella Saale è un'importante fonte di reddito. Viene menzionata una "torre keulichter (da "club")" (torre d'angolo all'angolo nord-orientale delle fortificazioni cittadine). Dal 1514 viene utilizzata per conservare la polvere da sparo ("torre della polvere"). 5 giugno: i sovrani concedono alla città il "privilegio del proiettile". Tutti i diritti feudali precedentemente dovuti ai sovrani vengono trasferiti alla città, che ottiene così un'ampia sovranità finanziaria. Viene redatto il "Geschossbuch", che consente una prima stima del numero di abitanti (circa 2.600).
1407	Vengono confermati i primi statuti comunali (non sopravvissuti) per Lobeda.
1408	7 dicembre: il monastero di San Michele e il comune raggiungono un accordo per la costruzione della cappella della Santa Croce davanti a Löbdertor.
1409	Viene menzionata per la prima volta la carica di maestro di mercato.
1413	Viene completata la costruzione del municipio nella sua attuale forma gotica. Il periodo principale di costruzione dell'edificio è stato tra il 1377 e il 1380. Aveva un predecessore del XIII secolo, alcune parti del quale sono state incorporate nel nuovo edificio.
1414	29 maggio: i langravi della Turingia concedono all'Ordine Carmelitano un appezzamento di terreno di fronte al Löbdertor per la costruzione di un monastero.
1416	29 marzo: nel sobborgo settentrionale di Nollendorf viene menzionato lo Jakobsspital (infermeria) per i cosiddetti "malati speciali", malati gravi o incurabili che presentano un rischio di infezione.
1418	Si conclude il processo di fondazione del nuovo monastero carmelitano. Ora in città ci sono tre monasteri: quello domenicano, quello carmelitano e il convento cistercense.
1419	12 marzo: l'associazione di un gruppo di persone che si impegnano a spegnere gli incendi in cambio di uno sconto fiscale può essere considerata il primo "corpo di pompieri volontari" di Jena. 21 aprile: viene confermata l'esistenza di una "casa delle donne" (bordello) di fronte alla Saaltor; la "Frauengasse" compare già nel catasto del 1406.
1424	Il coro della chiesa di Santa Maria a Ziegenhain viene consacrato come luogo di pellegrinaggio per un'immagine miracolosa della Vergine Maria.
1429	20 giugno: i sovrani vendono alla città le corti superiori e inferiori e la dogana di Jena.
1430	1 aprile: una casa nella Jenergasse compare nei documenti come "alde schule".
1430/31	Per timore di attacchi hussiti, le fortificazioni cittadine vengono ampiamente riparate e ampliate o parzialmente ricostruite (costruzione di bastioni angolari, ampliamento delle opere del fossato, nuove torri portaie con opere esterne davanti).
1431	19 giugno: la menzione documentaria di una sinagoga nel Leutragase è l'ultima testimonianza certa di una comunità ebraica a Jena.
1442	Viene completata la prima fase di costruzione della nuova chiesa cittadina gotica di Jena. Vengono completati, tra l'altro, il coro con un passaggio pubblico sottostante e il portale nuziale.
1446	20 giugno: a Jena si celebrano le nozze tra il langravio Guglielmo III di Turingia e Anna d'Austria, figlia maggiore del re Albrecht II. Inizia la "guerra fratricida sassone", che durerà fino all'inizio del 1451 e porterà anche a gravi devastazioni nei dintorni di Jena.
1448	14 maggio: il Consiglio di Jena ottiene il diritto di battere i pfennig con il simbolo di due acini d'uva.
1450	Agosto: la città di Lobeda viene quasi completamente distrutta una seconda volta dopo il 1446 nella guerra fratricida sassone. Anche il castello e il villaggio di Burgau e il castello di Lobdeburg vengono distrutti.
1452	5-9 settembre: il famoso predicatore penitenziale francescano Johannes Capistran soggiorna a Jena e predica a una grande folla.
1457	16 maggio: viene menzionato un secondo mercato settimanale a Jena.
1462	Un boia di Jena viene menzionato per la prima volta in un documento. Un riferimento a un'alta corte ("Galgenberg") si trova già nel Geschoßbuch del 1406.
1464	A Lutzendorf viene consacrata la chiesa di pellegrinaggio "Zu den 14 Nothelfern". Il nome del villaggio cambia in Vierzehnheiligen al più tardi nel 1482.
Dopo il 1470	Inizia la costruzione di una seconda cinta muraria, costruita pochi metri davanti a quella più antica, spessa circa 2 metri e alta da 4 a 6 metri, concepita principalmente per l'uso di armi leggere.
1471	Inizia la costruzione del Palazzo della città di Jena come residenza secondaria dei signori della città di Wettin (secondo un'iscrizione edilizia non più esistente).
1474	Riprendonoi lavori di costruzione della chiesa cittadina di San Michele sotto la direzione dello scalpellino, scultore e maestro artigiano Peter Heierliß (fino alla sua morte nel 1507). Viene completato il mulino ufficiale di Burgau. Fino al 1628, viene utilizzato per la macinazione dai contadini dei villaggi appartenenti al distretto di Burgau.
Tra il 1477 e il 1480	Friedrich von Lunderstedt fa costruire a Lobeda un complesso castellano tardogotico - noto come "Castello Vecchio" o "Casa di Lobeda" - come centro di un maniero.
dopo il 1477	Gli uffici di Jena e Burgau vengono riuniti in un doppio ufficio che comprende circa 50 villaggi e viene amministrato congiuntamente da un balivo. Quest'ultimo è affiancato nelle sue funzioni ufficiali da un Amtsschösser (esattore delle tasse).
1478	31 agosto: vengono menzionati per la prima volta i "banchi del pane" per offrire prodotti da forno nei portici del municipio.
1480	6 giugno: il trasferimento della giurisdizione all'interno del Weichbild alla città porta alla prima descrizione precisa del Weichbild. Si parla di un "nuovo ponte di pietra" sulla Saale (l'attuale "ponte di Camsdorf").
1482	Il consigliere Nikolaus Theuerkauf dona la cappella di San Giacomo davanti alla porta di Zwätzen, vicino alla "Siechenhaus".
1484	Una targa a doppia stazione creatada Peter Heierliß reca la data 1484 (ubicazione originaria: davanti alla chiesa di San Giovanni; ubicazione attuale: cimitero di San Giovanni, davanti alla Friedenskirche).
1486	16 maggio: viene posta la prima pietra della nuova torre di San Michele.
1488	1 novembre: un decreto sovrano ("ordinanza cittadina") conferma la partecipazione dei rappresentanti della comunità, delle corporazioni degli artigiani e dei suburbani all'amministrazione cittadina, in particolare per le questioni contabili.
1490	Jena conta circa 3.800 abitanti.
1491	2 novembre: viene documentato l'inizio della costruzione del ponte di pietra della Saale tra Burgau e Lobeda.
1492	10 dicembre: viene concesso il permesso del sovrano per una quarta fiera ad Egidi (1° settembre) per il commercio di cavalli e bestiame.
1498	Primo riferimento all'esistenza della locanda "Zum Bären".
1499	Una fattura documenta l'esistenza della locanda "Zur Sonne(n)" (anche "Zur goldenen [güldenen] Sonne") nell'edificio sulla piazza del mercato, le cui parti più antiche risalgono al XIII secolo.