15e eeuw

tussen 1404 en 1409	Na lange twisten tussen het stadspatriciaat enerzijds en de ambachtsgilden en voorstadhouders anderzijds, krijgen de laatsten meer te zeggen in de raad. In de toekomst konden de ambachtslieden sommige stadsambten vanuit hun gelederen vervullen. Het bestaan van 14 gilden is gedocumenteerd.
1406	Op de Saale tussen Rasenmühle en Kunitz zijn vier viswateren gedocumenteerd die aan instellingen en particulieren worden verpacht. De overvloed aan vis in de Saale is een belangrijke bron van inkomsten. Er wordt melding gemaakt van een "keulichter (van "club") toren" (hoektoren op de noordoostelijke hoek van de stadsversterking). Vanaf 1514 wordt deze gebruikt voor de opslag van buskruit ("kruittoren"). 5 juni: De vorsten verlenen de stad het "projectielenprivilege". Alle tot dan toe aan de vorsten verschuldigde leenrechten worden overgedragen aan de stad, die daarmee een uitgebreide financiële soevereiniteit krijgt. Het "Geschossbuch" wordt opgesteld, waarmee een eerste schatting van het aantal inwoners (ongeveer 2.600) kan worden gemaakt.
1407	De eerste gemeentelijke statuten (die niet bewaard zijn gebleven) worden bekrachtigd voor Lobeda.
1408	7 december: Sint-Michaëlsklooster en de gemeenteraad bereiken een overeenkomst over de bouw van de Heilig-Kruiskapel voor Löbdertor.
1409	Het ambt van marktmeester wordt voor het eerst genoemd.
1413	De bouw van het stadhuis in zijn huidige gotische vorm wordt voltooid. De belangrijkste bouwperiode van het gebouw was tussen 1377 en 1380. Het had een voorganger uit de 13e eeuw, waarvan afzonderlijke delen in het nieuwe gebouw werden opgenomen.
1414	29 mei: De Thüringse landgraven geven de karmelietenorde een stuk grond voor de Löbdertor voor de bouw van een klooster.
1416	29 maart: In de noordelijke voorstad Nollendorf wordt het Jakobsziekenhuis (ziekenboeg) voor zogenaamde "bijzondere zieken", ernstig of ongeneeslijk zieke mensen met besmettingsgevaar, opgericht.
1418	De oprichting van het nieuwe karmelietenklooster is voltooid. Er zijn nu drie kloosters in de stad: het Dominicanenklooster, het Karmelietenklooster en het Cisterciënzerklooster.
1419	12 maart: De vereniging van een groep mensen die zich verplichten om branden te blussen in ruil voor een belastingvermindering kan worden beschouwd als de eerste "vrijwillige brandweer" in Jena. 21 april: Het bestaan van een "vrouwenhuis" (bordeel) voor de Saaltor wordt bewezen, de "Frauengasse" komt al voor in het kadaster van 1406.
1424	Het koor van de Mariakerk in Ziegenhain wordt gewijd als bedevaartsoord voor een miraculeus Mariabeeld.
1429	20 juni: De vorsten verkopen het hooggerechtshof, het laaggerechtshof en de douane van Jena aan de stad.
1430	1 april: Een huis in de Jenergasse verschijnt in documenten als "alde schule".
1430/31	Uit angst voor aanvallen van de Hussieten worden de vestingwerken van de stad uitgebreid en uitgebreid of gedeeltelijk herbouwd (bouw van hoekbastions, uitbreiding van de grachtwerken, nieuwe poorttorens met buitenwerken aan de voorkant).
1431	19 juni: De documentaire vermelding van een synagoge in de Leutragase is de laatste zekere vermelding van een joodse gemeenschap in Jena.
1442	De eerste bouwfase van de nieuwe gotische stadskerk van Jena wordt voltooid. Onder andere het koor met een openbare doorgang eronder en het bruidsportaal worden voltooid.
1446	20 juni: Het huwelijk van landgraaf Wilhelm III van Thüringen en Anna van Oostenrijk, de oudste dochter van koning Albrecht II,vindt plaats in Jena . De "Saksische broederoorlog" begint, die tot begin 1451 duurt en ook in het gebied rond Jena tot grote verwoestingen leidt.
1448	14 mei: De Raad van Jena krijgt het recht om pfennig te slaan met het symbool van twee druiven.
1450	Augustus: De stad Lobeda wordt na 1446 voor de tweede keer bijna volledig verwoest in de Saksische broederoorlog. Ook kasteel Burgau en dorp en kasteel Lobdeburg worden verwoest.
1452	5-9 september: De beroemde Franciscaanse boeteprediker Johannes Capistran verblijft in Jena en preekt voor een grote menigte.
1457	16 mei: Er wordt melding gemaakt van een tweede weekmarkt in Jena.
1462	Een beul uit Jena wordt voor het eerst genoemd in een document. Een verwijzing naar een hooggerechtshof ("Galgenberg") is al te vinden in het Geschoßbuch van 1406.
1464	De bedevaartskerk "Zu den 14 Nothelfern" wordt ingewijd in Lutzendorf. De naam van het dorp verandert uiterlijk in 1482 in Vierzehnheiligen.
Na 1470	Er wordt begonnen met de bouw van een tweede stadsmuur, die een paar meter voor de oudere muur wordt gebouwd, ongeveer 2 meter dik en 4 tot 6 meter hoog.
1471	Begin van de bouw van het Jena-stadspaleis als secundaire residentie van de heren van de stad Wettin (volgens een bouwinscriptie die niet meer bestaat).
1474	De bouw van de stadskerk St. Michael wordt hervatonder leiding van de steenhouwer, beeldhouwer en meester-ambachtsman Peter Heierliß (tot zijn dood in 1507). De officiële molen in Burgau wordt voltooid. Tot 1628 wordt hij gebruikt om te malen door de boeren van de dorpen die tot het district Burgau behoren.
Tussen 1477 en 1480	Friedrich von Lunderstedt laat in Lobeda een laatgotisch kasteelcomplex bouwen - bekend als het "Oude Kasteel" of "Lobeda Huis" - als centrum van een landhuis.
na 1477	De ambten van Jena en Burgau worden samengevoegd tot een dubbel ambt dat ongeveer 50 dorpen omvat en gezamenlijk wordt bestuurd door een baljuw. Hij wordt in zijn ambt ondersteund door een Amtsschösser (belastingontvanger).
1478	31 augustus: er wordt voor het eerst melding gemaakt van "broodbanken" voor het aanbieden van gebakken waren in de arcades van het stadhuis.
1480	6 juni: De overdracht van de jurisdictie binnen het Weichbild aan de stad leidt tot de eerste precieze beschrijving van het Weichbild. Er wordt melding gemaakt van een "nieuwe stenen brug" over de Saale (de huidige "Camsdorfbrug").
1482	Raadslid Nikolaus Theuerkauf schenkt de Jacobuskapel voor de Zwätzenpoort bij het "Siechenhaus".
1484	Een dubbele stationsplaquette gemaaktdoor Peter Heierliß draagt de datum 1484 (originele locatie: voor de Johanneskerk; huidige locatie: Sint-Janskerkhof, voor de Friedenskirche).
1486	16 mei: De eerste steen wordt gelegd voor de nieuwe toren van St Michael.
1488	1 november: Een soeverein decreet ("stadsordonnantie") bevestigt de deelname van vertegenwoordigers van de gemeenschap, de handwerksgilden en de voorstedelingen aan het stadsbestuur, met name op het gebied van de boekhouding.
1490	Jena heeft ongeveer 3.800 inwoners.
1491	2 november: Het begin van de bouw van de stenen Saale-brug tussen Burgau en Lobeda wordt gedocumenteerd.
1492	10 december: Een soevereine toestemming wordt verleend voor een vierde jaarmarkt in Aegidi (1 september) voor de handel in paarden en vee.
1498	De eerste vermelding van het bestaan van de herberg "Zum Bären".
1499	Een factuur documenteert het bestaan van de herberg "Zur Sonne(n)" (ook "Zur goldenen [güldenen] Sonne") in het gebouw op het marktplein, waarvan de oudste delen dateren uit de 13e eeuw.